北京商贸学校食品商务专业部在建设发展过程中，以服务社会、服务行业、服务企业为宗旨，合理设置专业。目前设置专业有：产品质量监督检验专业（3+2）（食品质量监督检验方向）、特种动物养殖专业（3+2）（实验动物方向）、宠物养护与经营专业（3+2）、电子商务专业（3+2）、铁道运输服务专业（3+2）。
产品质量监督检验专业（3+2）（食品质量监督检验方向）
基于教育部“国家中等职业教育改革发展示范学校建设”的重点专业、北京市示范专业及北京市职业院校特色高水平骨干专业群“食品安全与流通专业群”核心专业，与北京农业职业学院食品检验检测技术专业实现中高职衔接，依托北京首农食品集团的行业优势，实现"校企合作，共同育人"，高规格的技能培养实现高技能人才输送。
特种动物养殖专业（3+2）（实验动物方向）
与北京农业职业学院动物医学专业对接，面向现代养殖业、动物资源开发及保护领域的中等职业教育专业，旨在培养掌握特种动物繁育技术、饲养管理、疾病防治及市场经营能力的技能型人才。岗位主要面向科研院所、医药研发企业和检测检验机构等单位，从事医学动物实验、实验动物生产和产品销售等领域相关工作。
宠物养护与经营专业（3+2）
宠物养护与经营专业是面向宠物服务行业的中等职业教育专业，与北京农业职业学院宠物医疗技术专业对接，旨在培养掌握宠物护理、美容、驯导、健康管理及宠物店铺运营等综合技能的实用型人才。毕业生面向宠物饲养与驯导、宠物美容与护理、宠物保健、宠物医疗辅助、宠物食品生产、宠物经营等技术领域，可从事宠物美容师、宠物健康护理员、宠物驯导师等职业。
电子商务专业（3+2）
北京商贸学校电子商务专业是学校首批“国家中等职业教育改革发展示范校”重点建设专业，紧密对接首都数字经济与现代服务业发展需求，聚焦电子商务全产业链，涵盖网店运营、新媒体营销、跨境电商、大数据分析等领域。拥有全国领先的“O2O实战化教学与训练平台”，实现“教学—实战—评价”一体化，覆盖商品e化、网店运营、客户服务等核心技能模块。与国家级骨干高职院校北京信息职业技术学院（电子商务专业）、北京农业职业学院（国际经济与贸易（国际关务管理方向））两所高职合作“3+2”中高职衔接项目，实现学历与技能双提升。
铁道运输服务专业（3+2）
铁道运输服务专业是北京市首批铁道相关专业，是教育部首批“国家中等职业教育改革发展示范校”重点建设专业。对接北京信息职业技术学院通信系统运行管理专业，该学院办学实力雄厚，校企合作基础好。培养具有铁路运输和城市轨道交通系统运行管理相关知识，具备铁路客运服务、城市轨道交通设备运营、维护，通信系统终端产品维修等职业能力的高素质技术技能人才。
