20世纪 60年代，为保障人民生活，更好的服务市民，急需培养相关人才，北京市在副食品行业酝酿成立职工学校。根据这一精神，经多方准备，1964年8月在海淀区北蜂窝101号正式成立了北京市半工半读副食品商业学校，此为北京商贸学校前身。学校初创时期历经半工半读学校、技工学校、七·二一大学、五·七干校四种办学形式，至1978年止，为北京市基层商业企业特别是二商局企业培养了大批人才，为首都商业发展在人才培养方面做出了不可磨灭的贡献。
1976 年“文化大革命”结束，1978 年 11 月党的十一届三中全会召开。随着国家的改革调整和科教兴国方针的实施，1979年4月，经市教委等三部委批准，在二商技校原址成立了北京市第二商业学校。1984年七月经北京市政府批准，在南苑福利农场成立了北京市二商局职工大学。同时经二商局党委研究决策，系统内教育机构几经调整。为适应二商局改制和学校发展需要，1992年8月，二商学校和职大合并，实现了两校优势互补、资源共享，为学校以后的快速发展奠定了基础。
1997 年始，学校进入了快速发展时期。学校进行了全方位大刀阔斧的改革，全体教工在领导班子带领下，团结奋进、开拓创新，以较快速度使学校实现了连上三个台阶的跨跃式发展。1998年 10月，学校被评为市级中专骨干校;2000年10月被教育部批准为国家级重点中专校;2002年2月被市政府批姓为北京市中等职业教育首批现代化标志校;7月被国家教育部等三部委授予全国职教先进单位称号，2003年11月被教育部命名为全国职业技术教育职业指导先进学校;12月在国家级重点中专校复评中，被评为北京市5所优秀校之首。
2013年4月，学校的发展又掀开新的一页，新一届领导班子在老校长退休之际成立。摆脱生源严重萎缩困局，使学校持续发展，是摆在人们面前的首课题。必须有新思路、新办法。新的领导班子以示范校建设为契机，立足于行业，面向首都现代服务业，重新进行专业规划设置。制定了“双轮驱动”的发展方针。在二商集团主导下，与北京城市学院合作，成立了京商学院。会计专业和产品质量监督检验专业分别和相关高职学院实现了“3+2”中高职对接，满足不同层次学生的要求为学生提供了更广阔的发展空间。学校已形成中高职一体化 雏形。
